prikaz prve stranice dokumenta Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove
  Download
PDF 1.93 MB
undergraduate thesis
Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove
2018. urn:nbn:hr:176:658973
Županić, Katarina
University of Split
University Department of Health Studies

Cite this document

Županić, K. (2018). Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove (Undergraduate thesis). Split: University of Split. Retrieved from https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić, Katarina. "Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove." Undergraduate thesis, University of Split, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić, Katarina. "Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove." Undergraduate thesis, University of Split, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić, K. (2018). 'Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove', Undergraduate thesis, University of Split, accessed 12 December 2024, https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić K. Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove [Undergraduate thesis]. Split: University of Split; 2018 [cited 2024 December 12] Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

K. Županić, "Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove", Undergraduate thesis, University of Split, Split, 2018. Available at: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Please login to the repository to save this object to your list.
Metadata
TitleKvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove
Title (english)QUALITY OF RNA MOLECULE ISOLATED FROM BLADDER CARCINOMA SAMPLES EMBEDDED IN PARAFFIN BLOCKS
AuthorKatarina Županić
MentorVedrana Čikeš Čulić (mentor)
Committee memberVedrana Čikeš Čulić (član povjerenstva)
Committee memberNikolina Režić Mužinić (član povjerenstva)
Committee memberMario Marendić (predsjednik povjerenstva)
GranterUniversity of Split
(University Department of Health Studies)
Split
Defense date and country2018-07-18, Croatia
Scientific / art field,
discipline and subdiscipline		BIOMEDICINE AND HEALTHCARE
Clinical Medical Sciences
Abstract
CILJ: FFPE uzorci su vrijedan izvor za istraživanje biomarkera karcinoma. Takve studije traže izolaciju nukleinske kiseline iz ograničenih količina uzoraka tkiva. Cilj ovog istraživanja jest procijeniti kvalitetu RNA molekule izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove korištenjem GenElute FFPE RNA Purification kita (Sigma Aldrich). METODE: Koristili su se uzorci pacijenata koji su bili podvrgnuti transuretalnoj resekciji tumora mokraćnog mjehura i čiji su uzorci nakon patološke obrade uklopljeni u parafinske blokove. RNA se izolirala pomoću prije spomenutog kompleta, pridržavajući se uputa proizvođača. Šest je koraka u postupku izolacije:1. Deparafinizacija, 2. Priprema lizata, 3. Vezanje RNA na kolonu, 4. Dodatni korak uklanjanja DNA, 5. Ispiranje kolone te završni korak 6. Eluiranje RNA. Provjera koncentracije i čistoće RNA izvšila se spektrofotometrijskim testom na NanoDropu (Thermo Scientific NanoDrop Products) REZULTATI: Obrađeno je 36 uzoraka, od kojih 4 nisu prikladna za daljnje korištenje. Ostali uzorci zadovoljavaju kriterije koncentracije i čistoće RNA. Koncentracije iznad 30 ng/µL su uzete kao prihvatljive vrijednosti. Omjeri apsorbancija A260/A280 koji ukazuju na čistoću RNA u većine uzoraka su bili prihvatljivi uz minimalna odstupanja (1,81-2,06) ZAKLJUČCI: Korištenje Sigma's GenElute FFPE RNA Purification kompleta potvrdilo je početnu hipotezu. Ovaj komplet pruža mogućnost brze i jednostavne izolacije te donosi velike prinose i čistoću izolirane RNA.
Abstract (english)
AIM: FFPE samples are a valuable source for cancer biomarker research. Such studies require the isolation of nucleic acid from limited amounts of tissue samples. The aim of this study is to evaluate the quality of the RNA molecule isolated from bladder tumor tissue samples incorporated in paraffin blocks using the GenElute FFPE RNA Purification Kit (Sigma Aldrich). METHODS: We used samples of patients who had undergone transurethal resection of the bladder tumor and whose samples were incorporated into paraffin blocks, after pathological treatment. RNA was isolated using the before mentioned kit, in accordance with the manufacturer's instructions. There are six steps in the isolation process: 1. Deparafinisation, 2. Preparation of lysate, 3. RNA binding on the column, 4. Additional step of DNA removal, 5. Washing of the column, and final step 6. Elution of RNA. Concentration and purity of RNA were checked by spectrophotometric assay at NanoDrop (Thermo Scientific NanoDrop Products). RESULTS: 36 samples were processed, of which 4 are not suitable for further use. Other samples meet the concentration and purity criteria of RNA. Concentrations above 30 ng/μL were taken as acceptable values. A260 / A280 absorbance ratios that indicate the purity of RNA were acceptable in most samples, with minimal deviations (1.81-2.06). CONCLUSIONS: The use of Sigma's GenElute FFPE RNA Purification kit confirmed the initial hypothesis. This kit provides fast and easy isolation and high concentracion and purity of isolated RNA.
Keywords
Keywords (english)
Languagecroatian
URN:NBNurn:nbn:hr:176:658973
Study programmeTitle: Medical Laboratory Diagnostics (university/undergraduate)
Study programme type: university
Study level: undergraduate
Academic / professional title: sveučilišni prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) medicinska laboratorijska dijagnostika (sveučilišni prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) medicinska laboratorijska dijagnostika)
Type of resourceText
File originBorn digital
Access conditionsOpen access
Terms of useLicence In copyright icon
Created on2020-05-15 08:29:10