prikaz prve stranice dokumenta Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove
  Preuzmi
PDF 1.93 MB
završni rad
Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove
2018. urn:nbn:hr:176:658973
Županić, Katarina
Sveučilište u Splitu
Sveučilišni odjel zdravstvenih studija

Citirajte ovaj rad

Županić, K. (2018). Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove (Završni rad). Split: Sveučilište u Splitu, Sveučilišni odjel zdravstvenih studija. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić, Katarina. "Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove." Završni rad, Sveučilište u Splitu, Sveučilišni odjel zdravstvenih studija, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić, Katarina. "Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove." Završni rad, Sveučilište u Splitu, Sveučilišni odjel zdravstvenih studija, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić, K. (2018). 'Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove', Završni rad, Sveučilište u Splitu, Sveučilišni odjel zdravstvenih studija, citirano: 18.09.2023., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Županić K. Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove [Završni rad]. Split: Sveučilište u Splitu, Sveučilišni odjel zdravstvenih studija; 2018 [pristupljeno 18.09.2023.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

K. Županić, "Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove", Završni rad, Sveučilište u Splitu, Sveučilišni odjel zdravstvenih studija, Split, 2018. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:176:658973
Prijavite se u repozitorij kako biste mogli spremiti objekt u svoju listu.
Podaci o radu
NaslovKvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove
Naslov (engleski)QUALITY OF RNA MOLECULE ISOLATED FROM BLADDER CARCINOMA SAMPLES EMBEDDED IN PARAFFIN BLOCKS
AutorKatarina Županić
MentorVedrana Čikeš Čulić (mentor)
Član povjerenstvaVedrana Čikeš Čulić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaNikolina Režić Mužinić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMario Marendić (predsjednik povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Sveučilišni odjel zdravstvenih studija
Split
Datum i država obrane2018-07-18, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO
Kliničke medicinske znanosti
Sažetak
CILJ: FFPE uzorci su vrijedan izvor za istraživanje biomarkera karcinoma. Takve studije traže izolaciju nukleinske kiseline iz ograničenih količina uzoraka tkiva. Cilj ovog istraživanja jest procijeniti kvalitetu RNA molekule izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove korištenjem GenElute FFPE RNA Purification kita (Sigma Aldrich). METODE: Koristili su se uzorci pacijenata koji su bili podvrgnuti transuretalnoj resekciji tumora mokraćnog mjehura i čiji su uzorci nakon patološke obrade uklopljeni u parafinske blokove. RNA se izolirala pomoću prije spomenutog kompleta, pridržavajući se uputa proizvođača. Šest je koraka u postupku izolacije:1. Deparafinizacija, 2. Priprema lizata, 3. Vezanje RNA na kolonu, 4. Dodatni korak uklanjanja DNA, 5. Ispiranje kolone te završni korak 6. Eluiranje RNA. Provjera koncentracije i čistoće RNA izvšila se spektrofotometrijskim testom na NanoDropu (Thermo Scientific NanoDrop Products) REZULTATI: Obrađeno je 36 uzoraka, od kojih 4 nisu prikladna za daljnje korištenje. Ostali uzorci zadovoljavaju kriterije koncentracije i čistoće RNA. Koncentracije iznad 30 ng/µL su uzete kao prihvatljive vrijednosti. Omjeri apsorbancija A260/A280 koji ukazuju na čistoću RNA u većine uzoraka su bili prihvatljivi uz minimalna odstupanja (1,81-2,06) ZAKLJUČCI: Korištenje Sigma's GenElute FFPE RNA Purification kompleta potvrdilo je početnu hipotezu. Ovaj komplet pruža mogućnost brze i jednostavne izolacije te donosi velike prinose i čistoću izolirane RNA.
Sažetak (engleski)
AIM: FFPE samples are a valuable source for cancer biomarker research. Such studies require the isolation of nucleic acid from limited amounts of tissue samples. The aim of this study is to evaluate the quality of the RNA molecule isolated from bladder tumor tissue samples incorporated in paraffin blocks using the GenElute FFPE RNA Purification Kit (Sigma Aldrich). METHODS: We used samples of patients who had undergone transurethal resection of the bladder tumor and whose samples were incorporated into paraffin blocks, after pathological treatment. RNA was isolated using the before mentioned kit, in accordance with the manufacturer's instructions. There are six steps in the isolation process: 1. Deparafinisation, 2. Preparation of lysate, 3. RNA binding on the column, 4. Additional step of DNA removal, 5. Washing of the column, and final step 6. Elution of RNA. Concentration and purity of RNA were checked by spectrophotometric assay at NanoDrop (Thermo Scientific NanoDrop Products). RESULTS: 36 samples were processed, of which 4 are not suitable for further use. Other samples meet the concentration and purity criteria of RNA. Concentrations above 30 ng/μL were taken as acceptable values. A260 / A280 absorbance ratios that indicate the purity of RNA were acceptable in most samples, with minimal deviations (1.81-2.06). CONCLUSIONS: The use of Sigma's GenElute FFPE RNA Purification kit confirmed the initial hypothesis. This kit provides fast and easy isolation and high concentracion and purity of isolated RNA.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:176:658973
Studijski programNaziv: Medicinska laboratorijska dijagnostika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) medicinska laboratorijska dijagnostika (univ.bacc.med.lab.diag.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2020-05-15 08:29:10